吴敦义当选国民檔主席后，其两岸关系立场备受关注。据环球时报6月3日援引台媒报道，吴敦义近日接受专访时强调，自己坚决反对“台*独”，不会将“一中各表”表成“两个中国”或“一中一台”。吴敦义还表示，自己将争取访问北京，出席国共论坛。
与此同时，有台媒透露，现任国民檔主席洪秀柱将于18日亲自赴大陆出席海峡论坛，甚至可能会去北京出席第二次“习洪会”。对此，国民檔文传会2日回应说，海峡论坛正朝着洪秀柱出席的方向规划，关于“习洪会”双方也在协调中。
而3日国民檔高层却对此予以矙n猓莆拇�“根本是不知所云，自行揣测”，洪秀柱出席海峡论坛还在考虑中，有关“习洪会”的报道完全是空穴来风。
吴敦义（左）与洪秀柱（右）（图片来源：台湾《联合报》）
港媒独家专访吴敦义：瞄准国共论坛 争取到北京
最新一期的香港《亚洲周刊》刊登对吴敦义的专访，题为《吴敦义瞄准国共高峰会，争取访北京晤习总》。
《亚洲周刊》称，吴敦义当选后，有一种舆论盛传：洪秀柱是最后一个“中国国民檔人”，中国国民檔的时代，随着前主席洪秀柱步下舞台而划下句点，北京对新任主席吴敦义两岸正策立场始终存有疑虑。
对此说法，吴敦义在专访时进行回应。他表示，会坚决反对“台*独”，主张“九二共识”、“一中各表”。
他还提到，“一中各表”的“九二共识”不会表成“两个中国”，也不会表成“一中一台”。