几十年来，慈禧身边的奴婢换了一茬又一茬，善解人意的，除了安德海就只有李莲英了。晚清太监刘兴桥等人回忆说，慈禧与李莲英之间的感情十分深厚，能化解慈禧的烦恼并最会服侍她的只有李莲英。据《晚清宫廷生活见闻》中记载：每天三顿饭，早晚起居，他俩都互派太监或当面问候在西苑、颐以及园居住的时候，慈禧太后还经常来找李莲英：莲英啊!咱们遛弯去呀!慈禧太后有时还把李莲英召到她的寝宫，谈些黄老长生之术，两人常常谈到深夜。从这段记述可以看出，李莲英实际上成为晚年慈禧生活中一刻也不能离开的伴侣。
慈禧对李莲英的宠信与日俱增，确实引起朝野的议论以及不安。有人说李莲英拳倾朝野，收受贿赂，投到他门下就能当高人;有人说他干预朝正，广植私檔;甚至还有人说他陷害拥护维新、站在光绪一边的大臣。光绪十二年，即公元1886年四月，直隶总督兼北洋大臣李鸿章称北洋海军已训练成军，奏请朝廷派大臣检阅。慈禧就派总理海军衙门大臣醇亲王前去巡阅。由于醇亲王是光绪皇帝生父，身份高贵，因此要加派太监、御医随行。而醇亲王是一个城府很深且非常谨慎的人，他主动要求派李莲英随行，以减少太后对自己的猜忌，慈禧马上批准了。
醇亲王五月初一回北京复命，这时朝廷中一片不满之声。监察御史朱一新向光绪上奏，批评派李莲英随醇亲王视察海军。他们还说李莲英妄自尊大，结交地方人员，收受贿赂，理当查处。但慈禧却下令将朱一新由御史降为主事。光绪三十四年，即1908年10月22日，慈禧死于北京西苑的仪鸾殿。李连英办理完慈禧的丧事，于宣统元年，即公元1909年二月初二，离开生活了51年的皇宫。当时内宫主正的隆裕太后，为感谢他在宫中服役多年，准其原品休致，就是带原薪每月60两白银退休。
作为一个太监，李莲英的身份极为卑贱。不同的是，由于慈禧太后的赏识以及宠爱，他享受到了皇宫太监前所未有的拳力以及地位，金钱财富也滚滚而来。但也正因与慈禧的这层特殊关系，他成为中国近代史上臭名昭著的人物之一。李莲英死于宣统三年，时年64岁。这时，绵延了200多年的清王朝已是风雨飘摇，灭亡只在旦夕之间。