正当唐正*府边兵内调，把主要力量用于平定安史之乱的时候，西方的吐蕃，檔项就乘机向东发展势力，凤翔（今陕西凤翔）以西，邠州（今陕西彬县（市））以北的地方，已失去控制。郭子仪看到这种危机的存在，曾建议不可忽视这方面的问题，但都没引起代宗的重视。
广德元年（763）九月，吐蕃开始东进，边将向朝廷告急，宦人程元振置之不理，根本不向代宗报告。吐蕃顺利东下，很快到达泾州（今甘肃泾川），泾州刺史高晖投降，并引吐蕃深入内地，一直过了邠州（今陕西彬县（市）），代宗始有所闻。吐蕃继续东进至奉天（今陕西干县（市））、武功（今陕西武功西），京师震动，代宗才命雍王李适为关内元帅，郭子仪为副元帅，出地区咸阳（今陕西咸阳东）。郭予仪久居京师，手下没有军队，临时凑集了二十余人到咸阳，面对二十余万敌军，当然难以有所作为。他派人向皇帝告急，由于程元振从中作梗，也未能见到代宗。
吐蕃逼近长安，代宗仓促出奔陕州，郭子仪循秦岭而东，沿途收容唐军散兵，驻军在商州（今陕西商州）。他认为从商州出蓝田（今陕西蓝田），吐蕃自然不敢东进，代宗在陕州也就安全，于是，代宗没再坚持调他东去陕州的意见。郭子仪派长孙全绪率二百骑出蓝田，观察敌情。长孙全绪白天击鼓张旗，虚张声势；夜间多处燃火，使吐蕃不解其意。同时，还有数百人于夜间在长安城中击鼓呐喊，还发出郭子仪将率大军到来的消息使吐蕃惶恐不安。在这四面楚歌声中，吐蕃感到无力控制长安，只得撤兵西去。十二月，代宗回到长安，郭子仪等到浐水以东迎接。代宗羞愧的对郭子仪说：「用卿不早，故及于此。」自此以后，郭子仪的声望更高了。
平定仆固怀恩，又是郭子仪的一大功绩。安史之乱结束后，仆固怀恩率朔方兵驻屯汾州（今山西汾阳）。
河东节度使辛云京怀疑仆固怀恩与回纥有勾结，遂向代宗密奏仆固怀恩欲反。仆固怀恩受到猜疑，有诏书也不敢进京。当代宗征求除去仆固怀恩之策时，有人建议：仆固怀恩所统之兵皆郭子仪旧部，如果派郭子仪去统领这支军队，仆固怀恩就一筹莫展了。代宗遂命郭子仪为关内、河东副元帅、河中节度使。仆固怀恩感到危在旦夕，遂举兵反唐。他进攻太原失败，带三百人逃往灵州（今宁夏灵武）。郭子仪到了汾州，仆固怀恩所部，皆鼓舞涕泣，喜其来而悲其晚。仆固怀恩到了灵州，勾结回纥、吐蕃，大举内进。郭子仪奉命出地区奉天（今陕西干县（市）），在干陵之南大败仆固怀恩。永泰元年（765）九月，仆固怀恩再次勾结回纥、吐蕃内进。
仆固怀恩中途暴病而死，郭子仪用分化手段，拉拢回纥，共击吐蕃，迫使吐蕃退兵。