在1945年恢复上课之后，二教的一盏灯变成长明灯，楼梯上也会莫名出现血迹，晚上地下室经常能听到哭声，据传在上课时候黑板出现一张鬼脸怎么擦也擦不掉在当时引起不小的轰动，后来校方请专人来看，发现了在一堵墙后面埋藏着日本遗留下来的生化试验品和实验设备，日本为了掩饰罪行将他们埋藏起来。
北京大学五教609教室
在北京大学有一个叫烈士楼的地方后来改名为五教，五教的六楼一共有10个教室，南北两面教室正对着，但在这里流传着晚上不能到609教室去，因为这里面有个恐怖传闻：
几年之前有一位学姐在609教室熬夜写论文的时候，太困有点熬不住就把灯关了在教室睡一会，等她3点多醒过来时候发现身边多了很多同学，但渐渐发觉有点不对劲，人那么多却没有声音，而且教材都是文革之前的版本，她因为害怕也不敢说话，天亮之后才从昏迷中醒过来，之后就没好运过，自己也选择跳楼自杀了。
不知道这些灵异事件究竟是真是假，可能或多或少有点传闻的性质存在，其实都是源自于人的内心对于未知事物的一种恐惧感造成的一种环境。