为遮掩和毁灭屠杀罪证，从1894年11月下旬到翌年的1月中旬，日军先是对旅顺市街的被害者尸体进行了清理和草草掩埋，继而焚尸灭证。日军及其殖民机构将从市街里和水师营等处抓来的中国人编成三组抬尸队，分别把尸体抬到三个地方焚烧。第一处为万忠墓的沟下；第二处为修建船坞时的旧窑处；第三处是黄金山东麓。据《旅大史话》记载：(两万具)尸体抬了一个月才抬完。
焚尸的材料用的是煤炭和木船的船板与木块，并配有煤油。焚烧过程中，日军用铁条、铁管做成支架，将死者尸体支起来，以使其充分燃烧。骨灰集中在四口大棺材内，丛葬于白玉山东麓的安葬岗。坟前立一木桩，写有“清军将士战亡之所”的字样，借以欺骗世人，掩饰屠杀焚烧包括妇女儿童在内的平民和俘虏的罪行。
1896年11月，日军撤出旅顺后，清朝人员顾元勋树立了万忠墓的第一块碑石，亲书“万忠墓”三个大字并修建享殿，以示祭奠。后又分别在1922年、1948年经过维修并树碑。碑阴铭文记述了日军暴行和重修万忠墓的经过。
1931年，九一八事变后，旅顺再次让日本人占领，在其奴役下过着水深火热的生活，每个旅顺人都对日本人恨之入骨。
1945年八月日本投降以后，我们的旅顺终于归还了我们中国的手里。
新中国成立后，旅顺口因为风景独特加上历史悠久，成了国内著名的旅游景点。每年都有无数来自世界各地的人来参观，但唯独看不到一个日本人，这是因为旅顺口禁止日本人进入，这也是全国唯一一个明文禁止日本人进入的地方。
旅顺在百年历史中的苦难过于深重，那些印记已不是刺在肌肤上的字，而是烙在心底的印，随时让人疼痛，也随时让人警醒。至今旅顺人民完全不能忘记日军当年的所作所为，他们在很多地方都立着牌子“禁止日本人进入”，不过后来引起的争议太多，改为“禁止不承认侵华历史的日本人入内”。
在旅顺，虽然没有人专门查游客身份，但每一个旅顺人都会自觉监督，只要发现日本人他们就会举报，一直到现在很多旅顺人都还保持着这个习惯。
旅顺口的这种做法得到了人们的广泛支持，还有人表示南京也应该学习这种做法，禁止日本人进入。朋友们：您认为呢？