弘光帝像
如此，弘光正拳如何能够抵挡得住朝气蓬勃的清朝？1645年正月，清军消灭了李自成的大顺正拳。三月，豫亲王多铎率军南征弘光正拳。五月，清军破南京城，而在此之前，弘光帝早已带着后妃逃到了芜湖靖国公黄得功的军营之中。黄得功虽然忠心护主，不过却在阵前中箭、不治而亡，而弘光帝则被黄得功营中叛徒作为献给清军的见面礼，一年后被清朝在北京处死。
弘光帝的被俘可谓是咎由自取，他继位时的明朝尚有可为，却因为他的冷漠导致南明失去了可以和清朝划江而治的机会，令人扼腕痛惜。
隆武帝：不甘
弘光帝被俘后，南明经历了潞王监国的短暂闹剧（七天降清）之后，又迎来了一位新的皇帝——隆武帝朱聿键，1645年闰六月初七，朱聿键在福州登基称帝。朱聿键原封唐王，是朱元璋第二十三子朱桱之后，因其父亲不受祖父喜爱，朱聿键十二岁时就和父亲一起被囚禁在王府之中，后因地方人员干预才得以继承王位。继承王爵后，朱聿键又因起兵勤王遭到崇祯皇帝的猜忌，被囚禁在凤阳的宗室监狱之中，他的前半生可谓命运多舛。
因缘际会，因为潞王降清之时，寓居杭州附近的明朝藩王都被清朝招降而去，时为唐王的朱聿键并没有投降，而是继续南下躲避清军，途中结识了福建军阀郑芝龙的弟弟郑鸿逵，在郑鸿逵的引荐下，郑芝龙拥戴朱聿键为帝，坚持抗清。
隆武帝
正是因为隆武帝前半生的坎坷，所以他胸怀大志，在明朝每况愈下的情况下毅然地挑起了抗清的大旗，正如他阅兵誓词所说的那样，他希望能够“恭行天讨，以光复帝室；驱逐清兵，以缵我太祖之业”。
隆武帝继位后，命令郑芝龙派兵出福建以策应江西的抗清义师；又摒弃檔争，收揽一切愿意抗清的仁人志士，甚至连崇祯皇帝钦定的“阉檔余孽”都不拘一格予以重用，“此后真正魏檔，亦与一概涤宽。但责后效，不计已往。”对于李自成的大顺军余部，他也极力拉拢以收为己用，他命督师堵胤锡将李自成的大顺军余部改编为“忠贞营”，与南明军队联合抗清。隆武帝的这一系列举措，都只为一个目标——光复帝室。
不过事与愿违，作为隆武朝的支柱，郑芝龙并不愿意牺牲自己的实力为明朝收复失地，反而在清朝的诱人之下选择降清，隆武帝只能前往江西寻找抗清力量。不幸的是，1646年八月二十八日，隆武帝、曾皇后一行在汀州被俘，并于当日被杀，相信临死之时的隆武帝心中满是不甘，未能“驱逐清兵”恐怕是其一生之遗憾。
永历帝：无奈
随着隆武帝的被俘，南明的形势每况愈下，清军不断向南推进，到1646年下半年之时，南明的领土已经缩小到剩下四川、湖广和云贵一隅之地，而且四川、贵州一部还掌握在张献忠的大西正拳手中。而一个更加迫切的问题又摆在了南明人员的面前——谁来做皇帝？
1646年形势图
然而，在两广还真有合适的人选——万历皇帝的孙子、桂王朱由榔，桂王一系原封湖南衡州，崇祯十六年因张献忠兵祸而逃亡广西梧州。之后，朱由榔的父兄先后去世，朱由榔继承了桂王爵位，后隆武帝被俘，桂王被拥立为帝，是为永历帝，也是广义明朝的最后一位皇帝。
永历帝生性懦弱，并不能担当重任，不过他的运气颇佳。清广东提督李成栋的反正归明，掀起了一波抗清高*潮，原本岌岌可危的形势得到了缓解。在李成栋反清失败后，张献忠的大西军余部孙可望、李定国等人又联合永历朝抗清，永历帝和南明又获得了喘息之机。
永历帝juz
不过，此时的清军已经占领全国大部分领土，再加上孙可望挑起的内讧，永历正拳和明朝注定不可能翻身了。1659年闰正月，永历帝和文武人员在清军的紧逼下已经退到了中缅边境，在清军的压力下，永历帝做了一个错误的决定，南明文人人员和两千多军队“尽释甲仗”，进入缅甸境内，成了毫无自主能力的流亡正拳。
1661年，吴三桂率军逼迫缅王交出永历帝，永历帝给吴三桂写了一封信，在信中永历帝动情地写道：“将军……即不为朕怜，独不念先帝乎？即不念先帝，独不念二祖列宗乎？即不念二祖列宗，独不念己身之祖若父乎？”