另外，日军还抓紧对晋西北、大青山地区、山东区的扫荡与"蚕食"，并在这些地区蛮横屠杀人民。
据统计，从1941年到1942年的两年内，日军对华北 解放区出动千人以上的扫荡就达174次，较前两年增加了近1倍。
1943年，日军对华北 解放区的进攻有增无减，对根据地人民的屠杀更加残暴。例如，1943年9月，日军对晋察冀边区北县（市）区进行了3个月的"秋季大扫荡"，制造了"阜平平阳惨案"、"易县（市）寨头惨案"、"平山岗南惨案"、"灵寿大寨惨案"、"井陉黑水坪惨案"、"平山焦庄惨案"等血腥暴行。仅3个月的时间，日军残杀我人民6674人，烧房54779间，抢掠与焚毁食粮2934万斤，抢走耕畜19300余头，毁农具172600余件，使北岳人民遭到了严重损失。 流离失所
抗战进入相持阶段后，日军常常有13个师团的兵力，对华中抗日根据地反复进行"清乡"、"清剿"、"扫荡"。平均每半个月，各根据地就要遭受1次扫荡，最频繁的时候则1周1次。"清乡"由苏南扩大至苏中、皖中和武汉近郊。特别是对苏中4分区的"清乡"连续不断进行，其残暴性是罕见的。
"全面清乡"失败后，日军又调集兵力，于6月在房东县（市）内开始"强化清乡"。他们推行"保甲制度"，发动"自首运动"，发放"良民证"，强迫大众挂门牌，携证件，不从者就烧房杀人。他们还化装搜寻，遇到行人就抓捕拷问，对所谓可疑者则加以杀害。
接着日军又进行了第3、第4期"强化清乡"、"高度强化清乡"。
在长达9个月的残暴的清乡中，苏中4分区付出了很大代价，县（市）区乡檔正干部牺牲200余人，大众被日军杀害者达1000余人，被抓走者6100余人，财产损失没法统计。
日军为了巩固其南侵的基地，消灭东江、琼崖根据地的军民，对华南敌后根据地实行了频繁的扫荡。东江根据地从创建之始，就遭到日军的围歼和扫荡，而且扫荡的范围1次比1次大。如"远道奔袭"、"拉锯清剿"、"铁壁合围"等，所到的地方，皆实行残暴的"3光"正策。